Анализ ДНК – эффективный метод диагностики хромосомных аномалий плода

Результаты нового исследования, которые недавно были опубликованы в журнале New England Journal, могут изменить подход к пренатальной диагностике основных хромосомных аномалий плода. Прямое сравнительное исследование неинвазивного метода анализа внеклеточной ДНК (cell free DNA, cfDNA) и стандартных методов скрининга показало, что ДНК-анализ с использованием пренатального теста verifi®, Illumina, Inc. значительно снижает вероятность получения ложноположительных результатов и имеет достоверно более высокое положительное прогностическое значение при диагностике трисомии по 21 хромосоме (синдром Дауна) и трисомии по 18 хромосоме (синдром Эдвардса) у плода.

Исследовательская команда под руководством доктора Дианы В. Бианчи (Diana W. Bianchi), исполнительного директора Исследовательского Института Матери и Ребенка (Mother Infant Research Institute, США) при Детском Госпитале Флоатинг (Floating Hospital for Children, США) в Медицинском Центре Тафтс (Tufts Medical Center, США), провела клиническое испытание неинвазивного пренатального теста verifi® на беременных женщинах.

Результаты мультицентрового слепого исследования, во время которого были проанализированы образцы 1 914 беременных женщин, показали, что неинвазивный метод анализа внеклеточной ДНК в 10 раз точнее выявляет трисомию по 21 хромосоме по сравнению со стандартными пренатальными методами скрининга анеуплоидии (изменения числа хромосом в клетке в большую или меньшую сторону от нормального). Важно, что эффективность метода анализа внеклеточной ДНК была одинаковой у всей выборки беременных женщин вне зависимости от риска наличия хромосомных аномалий плода. Результаты предыдущих исследований показали, что точность стандартных методов диагностики выше при обследовании женщин с повышенным риском развития хромосомных аномалий плода. В новом же исследовании впервые сравнивались результаты анализа внеклеточной ДНК с результатами анализа крови и ультразвукового обследования – стандартными методами скрининга первого триместра беременных женщин на хромосомные патологии плода.

«Результаты наших исследований показали, что главное преимущество метода неинвазивного пренатального анализа ДНК заключается в значительном снижении ложноположительных результатов исследования. Применение метода пренатального анализа внеклеточной ДНК в качестве метода первичного скрининга может исключить необходимость выполнения многих инвазивных диагностических исследований (например, амниоцентеза), которые проводятся для подтверждения положительных результатов скрининга», – говорит Бианчи.

Проведение пренатального скрининга на наличие анеуплоидий плода рекомендовано Американской Коллегией Акушеров и Гинекологов (American College of Obstetricians and Gynecologists) в качестве рутинного теста при оказании пренатальной медицинской помощи. Ученые сравнили применяемые в настоящее время неинвазивные методы диагностики анеуплоидии, в частности, сывороточный биохимический тест и метод измерения толщины воротникового пространства (или шейной складки), с методом анализа внеклеточной ДНК. Сывороточный биохимический тест выявляет биомаркеры хромосомных аномалий, а метод измерения толщины воротникового пространства основан на измерении толщины пространства в затылочной части шеи плода при проведении ультразвукового обследования. При синдроме Дауна подкожное скопление жидкости в затылочной области шеи плода увеличивается. Метод анализа внеклеточной ДНК в пренатальном тесте verifi® заключается в картировании и подсчете фрагментов ДНК в образце крови матери и сравнении значений с таковыми референсных образцов. Внеклеточную ДНК получают из крови женщины на 10 неделе беременности.

Главной задачей исследования было сравнение частоты получения ложноположительных результатов при диагностике трисомии по 21 хромосоме и трисомии по 18 хромосоме с помощью двух методов. Частота получения ложноположительных результатов при трисомиях по 18 и 21 хромосомам среди обследованных методом анализа внеклеточной ДНК составила 0,45%, в то время как при стандартном обследовании этот показатель составил 4,2%, что является статистически достоверным различием.

Также ученые сравнили положительное прогностическое значение изучаемых диагностических методов. При диагностике трисомии по 21 хромосоме положительное прогностическое значение метода анализа внеклеточной ДНК составило 45,5%, по сравнению с 4,2%, установленными для стандартного анализа. В случае выявления трисомии по 18 хромосоме этот показатель для нового метода оценивался в 40,8%, в то время как для стандартного анализа – только в 8%.

«Сильная сторона этого исследования заключается в том, что оно проводилось в разнообразных клинических условиях, имитирующих реальную мировую медицинскую практику. Большинство пациенток, принявших участие в этом исследовании, были моложе 30 лет, вынашивали своего первого ребенка и забеременели внепланово. Обследованная популяция женщин отличалась расовым и этническим разнообразием, что приближает результаты нашего исследования к клинической практике. Мы также получили информацию об исходе беременности каждой из женщин, участвовавшей в исследовании», – говорит Бианчи.

Результаты исследования, недавно опубликованного в журнале New England Journal of Medicine, могут изменить способ пренатальной диагностики основных хромосомных аномалий у плода. (фото: © Valua Vitaly / Fotolia)

По материалам Tufts Medical Center

Литература:
1. Diana W. Bianchi, R. Lamar Parker, Jeffrey Wentworth, Rajeevi Madankumar, Craig Saffer, Anita F. Das, Joseph A. Craig, Darya I. Chudova, Patricia L. Devers, Keith W. Jones, Kelly Oliver, Richard P. Rava, Amy J. Sehnert. DNA Sequencing versus Standard Prenatal Aneuploidy Screening. New England Journal of Medicine, 2014; 370 (9): 799 DOI: 10.1056/NEJMoa1311037
2. Michael F. Greene, Elizabeth G. Phimister. Screening for Trisomies in Circulating DNA. New England Journal of Medicine, 2014; 370 (9): 874 DOI:10.1056/NEJMe1401129