Двойной захват в борьбе с гепатитом
3021
0
Только вот обнаружить эту самую точечную мутацию очень трудно. Как трудно, скажем, найти на лету среди множества практически одинаковых разноцветных бус только те, в которых, образно говоря, 87-я бусинка не красная, а синяя. И не просто найти, но успеть к этой бусинке быстро и прочно прицепить метку - чтобы потом всю эту искомую нить можно было обнаружить.
Чтобы проделать все это с образцом крови, в которой ДНК искомого вируса далеко не единственная, авторы предлагают использовать разработанный ими весьма хитроумный вариант ПЦР - полимеразной цепной реакции. Если попытаться обойтись без терминов, то "сухой остаток" таков.
К образцу, в котором, предположительно, есть ДНК одного из видов гепатита С, добавляют так называемые праймеры. Это короткие молекулы, которые присоединяются к началу и концу участка того участка ДНК вируса гепатита С, который есть у любого его субтипа и приблизительно в середине которого как раз и находится та самая "точечная мутация", которая определяет принадлежность ДНК к этому субтипу. Затем в раствор добавляют фермент полимеразу. Он перемещается вдоль этого участка ДНК и синтезирует точную его копию. Пробежал - построил - раствор нагрели - этот новый участок отвалился - вновь остудили - фермент выстроил новую его копию - и миллионы раз. В результате характерных для ДНК вируса гепатита С участков ДНК в образце стало много - достаточно для его обнаружения и идентификации.
Происходит это, по замыслу авторов, так. Помимо прочих ингредиентов в раствор добавляют специальный зонд. Его молекулы - сооружение довольно сложное. Во-первых, по строению он комплементарен участку ДНК вируса с той самой точечной мутацией. То есть, способен среди множества других распознать только участки ДНК конкретного субтипа и к ним "пристроиться". Но пристроиться не так уж прочно - как, скажем, застегнуть пальто на "правильную", но одну-единственную кнопку.
Во-вторых, к зонду присоединены две группы - одна флуоресцирует, другая эту флуоресценцию тушит. Причем тушит только на маленьком расстоянии, а на большом на интенсивность флуоресценции не влияет. Пока зонд в растворе, его молекула скручена в клубок, и эти группы расположены вблизи друг от друга. Когда же зонд пристраивается к "своей" ДНК, его молекула на ней распластывается, а полимераза "по ходу дела" как бы отгрызает флуоресцентную группу. Та освобождается и начинает вовсю светиться, причем светом определенной длины волны. А чтобы зонд, распознав "свой" участок, закрепился особенно тщательно, на его, зонда, молекулу, навешивают еще одну группу - стабилизатор.
В этом-то стабилизаторе - основная особенность нового диагностикума. Потому что. благодаря своему пространственному строению, этот стабилизатор прочно связывает молекулу зонда с нужным участком ДНК по пресловутому принципу ключа и замка. Или, если продолжать сравнение с застежкой на одну кнопку - как бы закрепляет соединение на расположенные с двух сторон от кнопки застежки-липучки. Они-то и удерживают вместе зонд с его целевой ДНК. Если же зонд вдруг ошибется и прицепится к участку ДНК с похожей, но другой, "неправильной", структурой, то этот "неправильный" комплекс стабилизатор сделать прочнее не сможет, зонд на ДНК не удержится, флуоресцентная группа в раствор не выделится - ну, значит, и не было там того вируса, ДНК которого этот зонд распознает.
Удобно и то, что зонды на разные субтипы вируса гепатита С авторы предложили метить разными флуоресцентными метками. Поэтому добавлять к образцу можно все сразу зонды, а по тому, каким светом засветится раствор в результате проведения ПЦР, можно будет сразу сказать, какой же именно вариант вируса был в образце. А по интенсивности флуоресценции определить - сколько в крови пациента этого вируса. И назначить соответствующее лечение. Которое сразит не пациента, а только определенный, мешающий ему жить, вирус.
Автор исследования: Александр Николаевич Синяков, кандидат химических наук, заведующий лабораторией медицинской химии , Новосибирск
Дополнительную информацию можно узнать здесь: (3832)30-46-53 или sinyakov@niboch.nsc.ru
www.informnauka.ru




