Идентифицирован 21 ген, связанный с уровнем холестерина
В результате самого масштабного исследования холестерина и других липидов крови, проведенного международным консорциумом, был идентифицирован 21 ген, ассоциированный с риском развития сердечно-сосудистых заболеваний и заболеваний, связанных с метаболизмом липидов. Открытие дополнило список возможных мишеней для терапевтических и других методов лечения сердечно-сосудистых нарушений, связанных с метаболизмом липидов, которые являются основной причиной смертности и нетрудоспособности.
В ходе исследования Международный Консорциум Генетики Липидов (The International IBC Lipid Genetics Consortium) использовал Кардиочип (Cardiochip) – инструмент для генетического анализа, разработанный профессором Бренданом Дж. Китингом (Brendan J. Keating), ученым из Центра Прикладной Геномики (Center for Applied Genomics) Детского Госпиталя Филадельфии (The Children's Hospital of Philadelphia) (США). С момента его создания в 2006 г. исследователи применяли Кардиочип для точного определения аллелей генов в десятках исследований. Устройство содержит примерно 50 тыс. ДНК-маркеров двух тысяч генов, вовлеченных в развитие сердечно-сосудистых заболеваний.
Результаты исследования опубликованы в American Journal of Human Genetics.
Консорциум, членами которого являются более 180 исследователей по всему миру, проанализировал генетические данные более 90 тыс. человек европейского происхождения. Сначала исследователи проанализировали данные, полученные с помощью Кардиочипа, для более 65 тыс. человек из 32 предыдущих исследований. Затем была проведена независимая репликация на другой группе в 25 тыс. человек.
21 ген связан с уровнем холестерина, и некоторые из генов, вероятно, сцеплены с полом
В ходе мета-анализа, объединившего результаты нескольких исследований, консорциум установил связь 21 нового гена с уровнем липопротеинов низкой плотности (ЛПНП, или «плохого холестерина»), липопротеинов высокой плотности (ЛПВП, или «хорошего холестерина»), общего холестерина и триглицеридов (жиров), а также подтвердил значимость 49 ранее известных генетических маркеров. Кроме того, исследователи установили, что некоторые из наиболее сильных маркеров, вероятно, сцеплены с полом: некоторые аллели с большей вероятностью появлялись у мужчин, другие – у женщин.
«На сегодняшний день это самое большое число ДНК-образцов, использующихся для исследования характеристики липидов. Работа показывает важность широкомасштабного международного научного сотрудничества для обнаружения новых генетических маркеров», - говорит Китинг.
«В то время как каждая отдельная аллель оказывает лишь небольшой эффект на характеристику липидов, их кумулятивный эффект может значительно увеличить риск развития заболевания у человека, - добавляет Фотиос Дренос (Fotios Drenos), доктор Университетского Колледжа Лондона (University College London) (Великобритания), - Это исследование подчеркивает, как объединение международных ресурсов и данных прокладывает дорогу к полноценным и неожиданным открытиям о генетике человека».
Для проведения исследования Китинг и Дренос объединили мощности четырех главных координирующих объектов: Центра Прикладной Геномики при Детском Госпитале Филадельфии (США), Института Кардиологии при Университетском Колледже Лондона (Institute of Cardiovascular Sciences) (Великобритания), Академического Медицинского Центра (АМС) (Амстердам, Нидерланды) и Департамента Кардиологии Университетского Медицинского Центра (Department of Cardiology at the University Medical Center) (Утрехт, США).
Будущие исследования определят, какие именно гены непосредственно вызывают развитие заболеваний
Консорциум продолжает работу над проектом по идентификации локусов, непосредственно вызывающих развитие заболеваний, и способных помочь разработке новых препаратов. Кроме того, значительные ресурсы выделяются консорциумом для идентификации взаимодействий между генетическими полиморфизмами (однонуклеотидными заменами в последовательности гена) и биологическими маркерами, связанными с сердечно-сосудистыми заболеваниями.
«Следом за недавно установленными терапевтическими мишенями, такими как рецептор LDL и фермент PCSK9, в ходе настоящего исследования была идентифицирована 21 потенциально новая мишень для разработки препаратов для лечения дислипидемии (нарушения соотношения липидов в крови). Наша команда исследователей в настоящее время начинает дополнительные исследования для определения вклада обнаруженных генов в развитие сердечно-сосудистых заболеваний», - поясняет главный автор исследования, доктор медицины и философии Университетского Медицинского Центра в Утрехте Фолкерт Ассельбергс (Folkert Asselbergs).
По материалам Children's Hospital of Philadelphia
Оригинальная статья:
Folkert W. Asselbergs et al. Large-Scale Gene-Centric Meta-analysis across 32 Studies Identifies Multiple Lipid Loci. The American Journal of Human Genetics, 2012; DOI: 10.1016/j.ajhg.2012.08.032