Вирусы могут «рассказать» историю путешествий человека

У одного человека были обнаружены геномы двух различных штаммов вируса простого герпеса 1-го типа (ВПГ-1), вызывающих распространенное герпетическое поражение губ. Полученные данные могут представлять интерес для судебной медицины, а также исследования влияния вирусов на течение заболевания у пациента. Результаты исследования, проведенного международной командой ученых под руководством группой Мориа Л. Цпара (Moriah L. Szpara), доцента биохимии и молекулярной биологии из Университета Штата Пенсильвании (Penn State University, США), были опубликованы в журнале Virology.

Большинство людей являются носителями ВПГ-1, инфицирование которым часто происходит непосредственно от матери вскоре после рождения. Приобретенный вирус сохраняется в организме человека в течение всей его жизни. Новые данные были получены от добровольца из США, у которого были выявлены одновременно два штамма этого вируса. Результаты исследования показали, что один штамм вируса ВПГ-1 распространен у лиц европейского/североамериканского происхождения, а другой – среди людей азиатского происхождения. Вероятно, инфицирование последним штаммом произошло при прохождении военной службы во время Корейской войны в 1950-х гг.

«Возможно, история жизни большинства людей «задокументирована» на молекулярном уровне с помощью штаммов ВПГ-1, носителями которых они являются», – говорит Дерек Гэзерер (Derek Gatherer), преподаватель кафедры биомедицинских и биологических наук при Университете Ланкастера (Lancaster University, Великобритания), один из членов исследовательской группы.

Результаты более ранних исследований этой же научной группы показали, что можно предсказать географическое происхождение ВПГ-1. Поскольку существуют азиатская, африканская и европейская/североамериканская разновидности вируса, и инфицирование чаще всего происходит в юном возрасте, результаты исследования предполагают, что штамм ВПГ-1 человека может указывать на место его рождения. Кроме того, два человека, которые несут идентичные штаммы ВПГ-1, скорее могут иметь родственные отношения, по сравнению с людьми, у которых штаммы вируса сильно различаются.

«Использование генетического анализа ВПГ-1 поможет точно узнать историю жизни человека, добавив дополнительную генетическую информацию, не содержащуюся исключительно в его геноме. Возможно, судебная вирусология начнет применяться так же, как и генетический анализ человеческой ДНК, который используется для поиска виновных при сборе образцов с места преступления и для поиска родственников неопознанных тел», – говорит Гэзерер.

«Мы работаем над созданием более эффективных способов секвенирования вирусных геномов из беспрецедентно малого количества исходного материала, чтобы провести идентификацию и сравнение образцов из различных источников, – комментирует Цпара. – Глубокое секвенирование таких вирусов, как ВПГ-1, обеспечит лучшее представление о генетическом разнообразии вирусов, носителем которых является человек, и эти данные содержат ценную информацию о том, как это влияет на течение заболевания человека».

Реконструкция капсида вируса простого герпеса, созданная на основе результатов электронной микроскопии. (фото: University of Wisconsin-Madison)

По материалам Penn State

Оригинальная статья:
Christopher D. Bowen, Daniel W. Renner, Jacob T. Shreve, Yolanda Tafuri, Kimberly M. Payne, Richard D. Dix, Paul R. Kinchington, Derek Gatherer, Moriah L. Szpara. Viral forensic genomics reveals the relatedness of classic herpes simplex virus strains KOS, KOS63, and KOS79. Virology, 2016; 492: 179 DOI: 10.1016/j.virol.2016.02.013