«Вселенная» онкогенома расширяется

29.01.201412770

Проанализировав геномы тысяч онкологических больных, ученые открыли множество новых онкогенов, расширив список ранее известных маркеров примерно на четверть. Результаты работы исследовательской группы также показали, что создать сравнительный каталог онкогенов для оценки типов рака можно, изучив лишь 100 тыс. образцов пациентов.

Проанализировав геномы опухолей тысяч пациентов с разными типами онкологических заболеваний, группа исследователей, возглавляемая сотрудниками Института Брода (Broad Institute, США), открыла множество новых онкогенов. Их оказалось гораздо больше, чем предполагалось, и, кроме того, исследование показало, что многие ключевые онкогены еще только предстоит открыть.

Результаты исследования опубликованы в журнале Nature.

«Наконец мы знаем, что необходимо сделать, чтобы получить полную картину генома рака человека, - говорит директор-учредитель Института Брода Эрик Ландер (Eric Lander), главный соавтор публикации, - Это невероятно интересно, поскольку информация о генах и связанных с ними сигнальных путях позволит открыть новые потенциальные мишени для лекарственных препаратов и поможет разработать эффективную комбинированную терапию».

За последние 30 лет исследователи нашли доказательства ключевой роли примерно 135 генов в развитии нескольких из 21 типа онкологических заболеваний, проанализированных в работе. В новом сообщении не только подтверждаются эти гены, но и на четверть расширяется список онкогенов. Работа позволила выявить 33 новых гена, играющих роль в механизмах клеточной гибели, роста клеток, стабильности генома, иммунном уклонении и других процессах.

«Одним из основных вопросов, который мы задавали, заключался в том, получили ли мы полную картину? Глядя на геном рака, мы понимали, что ответ отрицательный: необходимо открыть еще множество онкогенов», - рассказывает первый автор публикации Майк Лоуренс (Mike Lawrence), вычислительный биолог из Института Брода.

По оценкам исследователей, им необходимо проанализировать в среднем около 2 тыс. образцов каждого типа рака для того, чтобы каталогизировать большинство мутаций, то есть, около 100 тыс. образцов для 50 типов рака.

«Учитывая, что в мире примерно 32 млн человек страдает от рака, это оправданное число для исследования», - говорит один из главных авторов публикации Гэд Гетц (Gad Getz), директор Вычислительной Аналитической Группы Генома Рака (Cancer Genome Computational Analysis) при Институте Брода, ассоциированный член института.

Среди анализируемых типов рака есть те, в которых возникает множество разных мутаций – такие, как меланома и некоторые формы рака легкого – и те, в которые частота мутаций невелика, как, например, рабдоидная опухоль почки и медуллобластома, возникающие у детей.

В итоге ученые проанализировали геномы примерно 5 тыс. образцов опухолей, сравнив их с соответствующими образцами нормальных тканей. Используя методы, в которых группа является пионером в последние несколько лет, ученые повторно открыли практически все ранее известные основные онкогены этих типов, подтвердив свой подход.

Среди остальных генов, указанных исследователями, необходимо выявить, какие из них смогут стать важными мишенями для разработки лекарственных препаратов. Инициативная группа Института Брода, подобно онкологической программе Target Accelerator намерена заняться этим.

По материалам Broad Institute of MIT and Harvard

Оригинальная статья:
Michael S. Lawrence, Petar Stojanov, Craig H. Mermel, James T. Robinson, Levi A. Garraway, Todd R. Golub, Matthew Meyerson, Stacey B. Gabriel, Eric S. Lander, Gad Getz. Discovery and saturation analysis of cancer genes across 21 tumour types. Nature, 2014; DOI: 10.1038/nature12912


Ваш комментарий:
Только зарегистрированные пользователи могут оставлять комментарии. Чтобы оставить комментарий, необходимо авторизоваться.
Вернуться к списку статей