Тест BROCA выявляет 24 гена, ассоциированные с раком молочной железы

Начиная с 1994 г., тысячи женщин, больных раком молочной железы с семейным анамнезом, были протестированы на наличие наследуемых мутаций в генах BRCA1 и BRCA2. Большинству пациенток сообщили, что исследованные гены не несут патогенных мутаций. Результаты повторного генетического исследования, полученные с помощью теста, основанного на секвенировании нового поколения, позволили выявить у пациенток мутации в других генах, ассоциированных с развитием рака молочной железы.

С появлением методов секвенирования нового поколения, выявлением новых генов-кандидатов предрасположенности к развитию рака груди, а также сменой легального статуса генетического тестирования на выявление мутаций в генах BRCA1 и BRCA стало возможным определить, насколько часто пациенты с семейной историей рака груди имеют мутации в генах BRCA1 и BRCA, и как часто – в других генах.

Новое исследование было проведено специалистами из Университета Вашингтона (University of Washington, США) Мари-Клэр Кинг (Mary-Claire King), профессором медицины и геномных наук Американского Онкологического Общества (American Cancer Society), и доктором Томасом Уолшем (Tomas Walsh), младшим научным сотрудником медицинской генетики. Они осуществили секвенирование генов, вовлеченных в развитие рака молочной железы, в образцах ДНК, полученных от пациенток с данной опухолью, у которых тест на BRCA1 и BRCA2 не выявил мутаций. Основанием для проведения повторного тестирования послужил семейный анамнез рака молочной железы, что определялось учеными как наличие трех или более случаев этого заболевания или случаев рака яичников у родственников пациентки.

24 октября результаты исследования были озвучены доктором Уолшем на конференции Американского Общества Генетики Человека 2013 (American Society of Human Genetics 2013) в Бостоне.

При секвенировании всех генов, ассоциированных с развитием рака молочной железы, у пациенток, не имеющих мутации в генах BRCA1 и BRCA2, согласно результатам коммерческого теста, но в семьях которых часто диагностировался рак молочной железы, более чем в 25% случаев были выявлены другие мутации.

Секвенирование проводили с использованием теста BROCA – диагностического метода на основе секвенирования нового поколения, который был разработан и валидирован Уолшем и Кингом в 2010 г. Метод BROCA выявляет однонуклеотидные замены, инсерции и делеции, а также варианты числа копий в 24 генах, участвующих в развитии рака молочной железы.

Ученые использовали тест BROCA для исследования 2285 человек из 743 семей, в которых хотя бы у трех родственников был выявлен рак молочной железы или яичников. В каждом случае среди членов обследуемой семьи была хотя бы одна женщина, больная раком молочной железы, которой проводилось полное генетическое исследование на мутации в генах BRCA1 и BRCA2, но результаты тестирования были отрицательными. Примененные ранее коммерческие тесты основывались на секвенировании по Сангеру и дополнительном методе, направленном на выявление крупных геномных перестроек в обоих генах.

Из 743 семей у 26% (191 семья) были выявлены мутации, ассоциированные с наследственным раком груди. Всего было обнаружено 149 различных мутаций в 18 генах.

Из 191 семьи у 35% (66 семей) рак груди был обусловлен мутациями в генах BRCA1 и BRCA2, не выявленными коммерчески доступными методами.

В остальных 65% случаев (125 семей) у членов семей, результаты обследования которых были пересмотрены благодаря применению теста BROCA, не были обнаружены наследуемые мутации в генах BRCA1 и BRCA2, но они были выявлены в других генах, ассоциированных с развитием рака молочной железы.

Распространенность комплексного тестирования неуклонно растет. По мнению доктора Уолша, важно более четко определить риски, ассоциированные с наличием мутаций в каждом из этих генов, с целью их эффективного внедрения в клиническую практику.

По мнению доктора Кинга, специалистам необходимо делиться результатами исследований, полученными в разных центрах, проводящих генетическое тестирование на выявление рака молочной железы и рака яичников.

По материалам American Society of Human Genetics