Эффективный метод идентификации мутантных генов, ассоциированных с различными патологиями
01.04.2008
2767
0
27670
Новый метод, основанный на сравнении генов, имеющих сходные экспрессионные профили у человека и мыши, позволяет определять генетические основы многих заболеваний человека.
Огромное количество заболеваний человека вызываются мутациями в одном или нескольких генах. Определение таких мутантных генов даст возможность раскрыть молекулярные механизмы, лежащие в основе многих заболеваний, и позволит назначать индивидуальные и более действенные в сравнении с традиционными терапевтические схемы. В большинстве случаев мутантные гены, ассоциированные с тем или иным заболеванием, не известны, и ученые располагают знаниями только об участках хромосом (содержащих обычно сотни генов), где находятся мутации.
Несогласованность огромного множества данных о структуре и функциях генов, возникшая в результате секвенирования генома человека, препятствует получению полезной с биологической и медицинской точек зрения информацию.
Ученые из Туринского Университета в Италии и из Университета Ниймегена (University of Nijmegen) в Голландии, работающие под руководством Фернандино Ди Кунто (Ferdinando Di Cunto) и Паоло Проверо (Paolo Provero), предложили новый метод, позволяющий определять генетические основы многих распространенных заболеваний человека.
Они использовали интегративный подход для идентификации мутантных генов, вовлеченных в определенное заболевание и находящихся в известном участке хромосомы, для которого установлена связь с данной болезнью. Сложность определения конкретных мутантных генов, изменения в которых вызвали данное заболевание, связана с тем, что хромосомные регионы, ассоциированные с определенными заболеваниями, обычно содержат сотни генов.
Метод, предложенный учеными, основанный на сравнении генов, имеющих сходные экспрессионные профили у человека и мыши, позволяет успешно использовать многочисленные данные по активности генов для идентификации тех элементов, которые вовлечены в развитие данного заболевания.
Применив этот подход для анализа 850 недостаточно охарактеризованных геномных регионов из базы данных по генам и генетическим аномалиям человека OMIM (Online Mendelian Inheritance in Man), ученым удалось определить наиболее вероятные гены, ассоциированные с 81 наследственным заболеванием человека, включая разнообразные формы эпилепсии и мышечной дистрофии.
По словам ученых, результаты теоретического анализа мутантных генов с помощью этого метода необходимо подтверждать экспериментально. Предложенный метод обладает большим потенциалом и сможет значительно упростить определение молекулярных предпосылок, лежащих в основе многих заболеваний человека.
Статья Ugo Ala et al. «Prediction of Human Disease Genes by Human-Mouse Conserved Coexpression Analysis» опубликована в on-line журнале PLoS Computational Biology 21 марта 2008.
По материалам:
EurekAlert
Огромное количество заболеваний человека вызываются мутациями в одном или нескольких генах. Определение таких мутантных генов даст возможность раскрыть молекулярные механизмы, лежащие в основе многих заболеваний, и позволит назначать индивидуальные и более действенные в сравнении с традиционными терапевтические схемы. В большинстве случаев мутантные гены, ассоциированные с тем или иным заболеванием, не известны, и ученые располагают знаниями только об участках хромосом (содержащих обычно сотни генов), где находятся мутации.
Несогласованность огромного множества данных о структуре и функциях генов, возникшая в результате секвенирования генома человека, препятствует получению полезной с биологической и медицинской точек зрения информацию.
Ученые из Туринского Университета в Италии и из Университета Ниймегена (University of Nijmegen) в Голландии, работающие под руководством Фернандино Ди Кунто (Ferdinando Di Cunto) и Паоло Проверо (Paolo Provero), предложили новый метод, позволяющий определять генетические основы многих распространенных заболеваний человека.
Они использовали интегративный подход для идентификации мутантных генов, вовлеченных в определенное заболевание и находящихся в известном участке хромосомы, для которого установлена связь с данной болезнью. Сложность определения конкретных мутантных генов, изменения в которых вызвали данное заболевание, связана с тем, что хромосомные регионы, ассоциированные с определенными заболеваниями, обычно содержат сотни генов.
Метод, предложенный учеными, основанный на сравнении генов, имеющих сходные экспрессионные профили у человека и мыши, позволяет успешно использовать многочисленные данные по активности генов для идентификации тех элементов, которые вовлечены в развитие данного заболевания.
Применив этот подход для анализа 850 недостаточно охарактеризованных геномных регионов из базы данных по генам и генетическим аномалиям человека OMIM (Online Mendelian Inheritance in Man), ученым удалось определить наиболее вероятные гены, ассоциированные с 81 наследственным заболеванием человека, включая разнообразные формы эпилепсии и мышечной дистрофии.
По словам ученых, результаты теоретического анализа мутантных генов с помощью этого метода необходимо подтверждать экспериментально. Предложенный метод обладает большим потенциалом и сможет значительно упростить определение молекулярных предпосылок, лежащих в основе многих заболеваний человека.
Статья Ugo Ala et al. «Prediction of Human Disease Genes by Human-Mouse Conserved Coexpression Analysis» опубликована в on-line журнале PLoS Computational Biology 21 марта 2008.
По материалам:
EurekAlert
Ваш комментарий:
Только зарегистрированные пользователи могут оставлять комментарии. Чтобы оставить комментарий, необходимо авторизоваться.
Последние комментарии
